本发明公开了一种爱格氏菌AUH‑JLD49s及其在3′‑去甲基‑牛蒡苷元转化中的应用，属于细菌技术领域。爱格氏菌（Eggerthella sp.）AUH‑JLD49s，保藏号为CGMCC No.13124。其应用包括下述步骤：（1）菌株AUH‑JLD49s的培养；（2）底物3′‑去甲基‑牛蒡苷元粗品与菌株AUH‑JLD49s共培养及转化产物的分离纯化。本发明菌株能将中药牛蒡子中牛蒡苷元的一种微生物转化产物3′‑去甲基‑牛蒡苷元转化为3′‑去甲基‑4′‑去羟基‑牛蒡苷元，解决了3′‑去甲基‑4′‑去羟基‑牛蒡苷元资源缺乏的问题，对3′‑DM‑4′‑DH‑AG药理活性及新药研发具有极大的推动作用。
